Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hdac7Q8C2B3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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