Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FarsaQ8C0C7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FarsaQ8C0C7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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