Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim35Q8C006 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Trim35Q8C006 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trim35Q8C006 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trim35Q8C006 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms