Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcl3Q8BVF2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms