Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms