Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup54Q8BTS4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms