Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbp9Q8BTS3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms