Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia2Q8BSS9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms