Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Suds3Q8BR65 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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