Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Prpf18Q8BM39 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Prpf18Q8BM39 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prpf18Q8BM39 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prpf18Q8BM39 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prpf18Q8BM39 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Prpf18Q8BM39 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prpf18Q8BM39 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Prpf18Q8BM39 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Prpf18Q8BM39 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf18Q8BM39 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Prpf18Q8BM39 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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