Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem87bQ8BKU8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms