Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rufy1Q8BIJ7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms