Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX0

Trim23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim23Q8BGX0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim23Q8BGX0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim23Q8BGX0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim23Q8BGX0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trim23Q8BGX0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim23Q8BGX0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trim23Q8BGX0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trim23Q8BGX0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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