Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.6 ms