Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms