Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc172Q810N9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms