Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChfrQ810L3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms