Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nrde2Q80XC6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms