Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pcsk9Q80W65 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pcsk9Q80W65 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pcsk9Q80W65 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pcsk9Q80W65 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pcsk9Q80W65 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pcsk9Q80W65 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pcsk9Q80W65 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pcsk9Q80W65 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms