Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnphQ80U23 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms