Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms