Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo2Q7TSY8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms