Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnf1Q7TSH7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnf1Q7TSH7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms