Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sox11Q7M6Y2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sox11Q7M6Y2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms