Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubfd1Q78JW9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms