Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RfflQ6ZQM0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RfflQ6ZQM0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RfflQ6ZQM0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RfflQ6ZQM0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RfflQ6ZQM0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RfflQ6ZQM0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RfflQ6ZQM0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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