Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms