Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cnot1Q6ZQ08 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms