Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd4Q6ZPR5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms