Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rhox8Q6VSS7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rhox8Q6VSS7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms