Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd1Q6PIP5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms