Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sarm1Q6PDS3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms