Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trim37Q6PCX9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim37Q6PCX9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim37Q6PCX9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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