Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gga2Q6P5E6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gga2Q6P5E6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms