Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms