Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec23ipQ6NZC7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23ipQ6NZC7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms