Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NipblQ6KCD5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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