Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt77Q6IFZ6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms