Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt39Q6IFX4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krt39Q6IFX4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms