Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pram1Q6BCL1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pram1Q6BCL1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms