Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp7Q6A4J8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp7Q6A4J8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp7Q6A4J8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp7Q6A4J8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp7Q6A4J8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms