Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmcc1Q69ZZ6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms