Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Jmjd1cQ69ZK6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Jmjd1cQ69ZK6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms