Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Sh3rf1Q69ZI1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3rf1Q69ZI1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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