Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pkp4Q68FH0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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