Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp9cQ66X01 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nlrp9cQ66X01 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms