Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms