Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VclQ64727 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VclQ64727 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VclQ64727 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms