Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrmQ64674 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrmQ64674 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms