Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col4a5Q63ZW6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col4a5Q63ZW6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms